自2002年X档案的六年后,前联邦探员丹娜·斯科莉(吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰)调任某教会医院担任医师,福克斯·穆德(大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰)则过着隐居的生活,继续着对超自然现象的关注。某天,FBI探员前来请求他们的帮助。原来一段时间内,维吉尼亚州接连有数名女子神秘失踪,其中甚至包括一名联邦探员。由于神父约瑟夫(Billy Connolly 饰)声称看到了犯罪画面,因此FBI希望对超自然案件有着丰富经验的穆德和斯科莉协助调查。然而随着调查的深入,穆德和斯科莉却发现案件的黑暗远远超出他们的想象。这对合作多年的搭档面临着巨大的考验…… 本片为同名美剧的第二部剧场版。
母亲去世之后,阿曼达(莎拉•米歇尔•盖拉 Sarah Michelle Gellar 饰)继承了母亲生前精心经营的餐馆。然而没过多久,阿曼达便发现,从前门庭若市的餐馆,如今生意一天不如一天,甚至濒临了倒闭的边缘。 一次偶然中,阿曼达邂逅了名为汤姆(肖恩•派特里克•弗兰纳里 Sean Patrick Flanery)的男子。之后,汤姆在机缘巧合之下来到了阿曼达的餐厅吃饭,让阿曼达感到不敢相信的是,汤姆的存在令自己的厨艺大增,餐厅就此度过了这次经营危机。随着时间的推移,阿曼达和汤姆之间的距离越来越近,然而,汤姆对于阿曼达产生的种种误会使得后者感到深深的受伤,两人之间的感情产生了裂痕。